home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00721 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  834 b   |  23 lines
  1. ***********************************
  2. * Ribosomal protein L35 signature *
  3. ***********************************
  4.  
  5. Ribosomal protein L35 is one  of  the proteins  from the large  subunit of the
  6. ribosome. It belongs to a family of ribosomal  proteins which, on the basis of
  7. sequence similarities [1], groups:
  8.  
  9.  - Eubacterial L35.
  10.  - Plant chloroplast L35 (nuclear-encoded).
  11.  - Cyanelle L35.
  12.  
  13. L35 is a basic protein of 60 to 70 amino-acid residues. As a signature pattern
  14. we selected a conserved region in the N-terminal section.
  15.  
  16. -Consensus pattern: K-[LIVM]-K-T-x(2)-[GA]-x(2)-K-R-[LIVMFY]-[KR]
  17. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  18. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  19. -Last update: June 1994 / First entry.
  20.  
  21. [ 1] Otaka E., Hashimoto T., Mizuta K.
  22.      Protein Seq. Data Anal. 5:285-300(1993).
  23.